User interviews December 2020
Our field of activity is contract research and testing for life sciences industries including pharma, biotech, nutraceuticals, environmental sciences, food&agri testing, and diagnostics.
Multi-omics Analysis Package
LC/MS, GC/MS Data Analysis Software
멀티오믹스 분석 패키지는 대사학, 단백질체학 분석과 같은 분야에서 생성된 방대한 데이터를 자동으로 생성하고 다양한 데이터 분석을 수행할 수 있는 기능을 제공합니다. 이 패키지는 약물 발견, 생명공학 및 기타 생명과학 연구 응용 프로그램을 지원하는 강력한 플랫폼을 제공합니다.
Metabolic Map에서 대사 산물과 단백질의 정량적 변화를 자동으로 시각화
데이터를 Metabolic Map에 표시하고 상관관계를 분석하는 등 데이터를 분석하고 시각화하는 과정에 필요한 작업량을 획기적으로 줄여줍니다.
세계 최고의 연구 기관에서 개발한 소프트웨어와 완벽하게 작동
GARUDA™ 플랫폼에 연결된 다양한 다른 소프트웨어(Gadgets)와 결합하여 다차원 분석을 위한 최적의 워크플로우를 제공합니다.
데이터 수집부터 분석까지 운영에 대한 통합 지원
이 소프트웨어에는 해당 데이터 분석 장치와 연결되는 다양한 데이터 처리 장치가 포함되어 있어 단일 소프트웨어 프로그램의 원활하고 연결된 경험을 제공합니다. 샘플 전처리부터 분석 조건에 이르기까지 모든 것에 대해 "Ready-to-Use Methods"으로 준비된 다양한 시마즈 데이터베이스와 결합하여 작동하도록 설계되어 질량 분석기 측정부터 데이터 분석에 이르기까지 전체 프로세스 흐름을 원활하게 수행할 수 있습니다.
멀티오믹스 분석 패키지에서는 주로 일본 시스템 생물학 연구소(SBI)에서 관리하는 GARUDA 오픈 리서치 플랫폼에 공개된 도구(Gadgets)를 기반으로 개발된 데이터 분석 소프트웨어를 제공합니다.
다중 오믹스 분석 패키지의 프로세스 흐름
멀티오믹스 분석 패키지에는 해당 데이터 분석 장치와 연결되는 다양한 데이터 처리 장치가 포함되어 있어 단일 소프트웨어 프로그램의 원활하고 연결된 경험을 제공합니다. 또한 다양한 시마즈 데이터베이스와 결합하여 작동하도록 설계되어 질량 분석기 측정부터 데이터 분석까지 전체 프로세스 흐름을 원활하게 수행할 수 있습니다.
데이터 분석 예시
시간 경과에 따른 세포 배양 배지의 대사산물 수준 변화를 GC-MS 시스템을 사용하여 측정했습니다. 획득한 데이터는 멀티오믹스 분석 패키지를 사용하여 분석했으며 대사산물 변화를 Metabolic Map에 표시하여 시각화했습니다.
데이터 분석 도구
멀티오믹스 분석 패키지는 일본 시스템 생물학 연구소(SBI)가 주도하는 GARUDA 얼라이언스가 개발한 개방형 연구 플랫폼인 GARUDA 플랫폼에 출시된 소프트웨어 도구(Gadgets)를 기반으로 합니다.
멀티오믹스 분석 패키지에 사용되는 데이터 분석 도구
Volcano Plot
두 그룹 간의 차이를 시각화하기 위해 t-test (통계적으로 유의미한 차이)과 fold-change(예: 2배 또는 1/2과 같은 평균값의 차이)를 결합한 도구입니다. 시마즈가 개발한 Volcano Plot Gadgets이 패키지에 포함되어 있습니다.
VANTED
독일 콘스탄츠 대학교에서 다양한 데이터 세트 간의 네트워크 시각화 및 분석을 위해 유지 관리하는 도구입니다. (GARUDA 지원은 모나쉬 대학교에서 개발되었습니다.)
Cytoscape
사이토스케이프 컨소시엄에서 개발한 생물정보학 도구는 대사 경로를 시각화하고 유전자 발현 프로필을 관련 데이터와 통합하는 데 사용됩니다. 특히 네트워크를 분석하고 상관관계를 시각화하는 데 유용합니다.
오믹스용 메소드 패키지
데이터 분석 도구
- * 주요 대사산물 및 세포 배양 프로파일링을 위한 LC/MS/MS 방법 패키지에는 다중 오믹스 분석 패키지의 기능이 포함되어 있습니다.
GC/MS, GC-MS/MS 메소드 패키지 for Metabolites
GC/MS, GC-MS/MS 메소드 패키지 for Metabolites
LC/MS/MS MRM 라이브러리
LC/MS/MS 데이터베이스
- Exact Mass Database for Endogenous Metabolites
Smart Metabolites Database is a trademark of Shimadzu Corporation.
GARUDA is a trademark of The Systems Biology Institute.
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Applications
News / Events
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LCMS Food Safety Application is now available.
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Application Note: "Analysis of Pharmaceuticals' Impurity - Regulations and Analysis for Carcinogenic Substances -"
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Application Note: "Various Analysis Techniques for Organic Acids and Examples of Their Application"
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Shimadzu has released the Metabolites Method Package Suite.
Provides ready-to-use methods for over 1900 metabolites
This suite allows comprehensive analysis of over 1900 metabolites without the need for investigation of separation conditions, MRM optimization or parameter settings. -
Direct Probe Ionization Mass Spectrometer - APPLICATION NOTEBOOK -